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1、生物信息學(xué)課程授課內(nèi)容的選擇
生物信息學(xué)包括開發(fā)生物信息學(xué)工具的計算生物信息學(xué)和利用生物信息學(xué)工具解決問題的應(yīng)用生物信息學(xué)。醫(yī)學(xué)背景的生物技術(shù)專業(yè)的學(xué)生應(yīng)該立足于應(yīng)用生物信息學(xué)的學(xué)習(xí),特別擅長計算機和數(shù)學(xué)并且對生物信息學(xué)感興趣的同學(xué)也可以涉獵部分計算生物信息學(xué)的知識,本人在讀博士期間遇到過一個本科生就利用自己計算機方面的特長,進(jìn)行雄激素受體和雄激素受體調(diào)節(jié)劑構(gòu)效關(guān)系的研究,在指導(dǎo)教師的幫助下發(fā)表了一篇生物信息學(xué)領(lǐng)域的SCI文章,在感嘆難能可貴的同時,必須承認(rèn)指導(dǎo)教師敏銳的洞察到學(xué)生的特長,并發(fā)揮其特長會起到意想不到的效果。此外,國內(nèi)有關(guān)生物信息學(xué)方面的教材因編者學(xué)科背景相差很遠(yuǎn),各教材的特色和側(cè)重點有所不同,相對來講,偏理論輕實踐。醫(yī)學(xué)院校生物技術(shù)專業(yè)應(yīng)校根據(jù)本學(xué)科特點選擇實驗性較強的教材,制定具有生物技術(shù)專業(yè)特色的教學(xué)計劃及教學(xué)大綱,有條件有時間的教師可以嘗試自己編寫適合本院校學(xué)習(xí)的教材,那樣針對性更強,學(xué)習(xí)效果會更佳。針對生物技術(shù)專業(yè)的特點,因此我們將引物設(shè)計、基因查找、基因序列分析、同源基因和不同物種基因查找、判斷起始密碼子和終止密碼子位置、啟動子預(yù)測以及簡單的蛋白功能分析和常用數(shù)據(jù)庫的應(yīng)用作為本專業(yè)生物信息學(xué)知識學(xué)習(xí)的主體框架。另外,生物信息學(xué)的軟件本人傾向于選取在線工具,如引物設(shè)計軟件可選取NCBI網(wǎng)站上的primerblast,酶切位點分析也可在NEB公司的網(wǎng)站上在線分析,應(yīng)該說生物信息學(xué)的發(fā)展,歐美國家一些公立網(wǎng)站,如NCBI,或者某些相關(guān)實驗室的網(wǎng)站都提供多種現(xiàn)在分析的工具,極大地方便了使用者。一來及其方便解決了問題,避免了盜版問題;二來可以通過網(wǎng)站學(xué)習(xí)生物信息學(xué)相關(guān)知識,對某些軟件的歷史淵源有所了解。
2、生物信息學(xué)授課時間安排的合理性
生物信息學(xué)是一門實踐課程,實驗課應(yīng)該占40%以上比例,理論課也應(yīng)該利用多媒體教室講授,在實驗課之前應(yīng)該提前讓把本次課內(nèi)容通過多種即時通訊工具如QQ等發(fā)送給學(xué)生,在將核心知識在實驗課演練結(jié)束后,進(jìn)一步布置相關(guān)作業(yè)強化記憶,在實踐中掌握相關(guān)知識,如引物設(shè)計中,常用的是ncbi網(wǎng)站中在線引物設(shè)計工具primerblast和電腦安裝軟件prim-er5,在引物設(shè)計完成后,可以讓學(xué)生思考融合蛋白表達(dá)時移碼問題,即融合蛋白引物設(shè)計需要注意哪些問題,如涉及到移碼問題時如何設(shè)計引物?生物信息學(xué)是有力的應(yīng)用工具,但是還不能完全依賴生物信息學(xué),我們應(yīng)該成為生物信息學(xué)的高級應(yīng)用者。
3、生物信息學(xué)授課教師的選擇
生物信息學(xué)是一門交叉學(xué)科,但是筆者認(rèn)為長期應(yīng)用生物信息學(xué)的醫(yī)學(xué)背景的教師更適合作為醫(yī)學(xué)院校生物技術(shù)專業(yè)的授課教師。作為一門新興學(xué)科的一名教師保質(zhì)保量的完成全部授課任務(wù)還是有一定難度的,可以嘗試每位老師根據(jù)自己特長講授自己熟悉的章節(jié),這樣一來減少壓力,二來可以較為圓滿地完成教學(xué)任務(wù),不同教師還可以給學(xué)生帶來不同風(fēng)格的教學(xué)模式,提高學(xué)生的新鮮感和教師授課熱情。此外,任課教師應(yīng)該積極學(xué)習(xí)相關(guān)領(lǐng)域知識,目前很多國內(nèi)外著名高校通過網(wǎng)絡(luò)開始有生物信息學(xué)相關(guān)的開放課程或慕課,無論是學(xué)生還是任課教師都應(yīng)該積極參加其中,提高自己的理論知識和實踐技能,學(xué)習(xí)優(yōu)秀教師的授課技巧,領(lǐng)略該領(lǐng)域大家風(fēng)采,筆者就經(jīng)常參加北京大學(xué)等學(xué)校的開放課程,獲益匪淺。同時,在有條件情況下參加國內(nèi)外相關(guān)講座和學(xué)習(xí)班,和同領(lǐng)域的兄弟院校保持聯(lián)絡(luò),對生物信息學(xué)的教學(xué)和科研水平的促進(jìn)幫助大有裨益。
4、扎實的理論是學(xué)好生物信息學(xué)的保障
除了具有學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的熱情,學(xué)習(xí)生物信息學(xué)的醫(yī)學(xué)生還應(yīng)該掌握與生物信息學(xué)緊密相關(guān)的知識,如分子生物學(xué)、分子診斷學(xué)、計算機相關(guān)知識和統(tǒng)計學(xué)知識。有條件的學(xué)生應(yīng)該主動參與科研課題,不論是本院校老師申請的,還是大學(xué)生課題,都會對學(xué)習(xí)生物信息學(xué)有所幫助。本人讀博士期間,就遇到很多在讀本科生參與博士生導(dǎo)師的課題,在基因序列分析和蛋白功能研究方面都獲益匪淺。本人目前也作為指導(dǎo)教師指導(dǎo)本科生獨立申請的大學(xué)生課題,在給學(xué)生講授生物信息學(xué)時,明顯感覺參與過科研項目的學(xué)生對生物信息學(xué)知識的掌握,明顯強于沒有參與過的本科生。總之,我們生物信息學(xué)課程教學(xué)中做出了一定的探索,也取得了一定的經(jīng)驗和效果,但是這只是萬里長征的第一步,需要生物信息學(xué)課程的教師更加努力探索,為培養(yǎng)出更多適應(yīng)社會發(fā)展需要的高素質(zhì)應(yīng)用型人才貢獻(xiàn)自己的微薄之力。
作者:郝峰許會靜姜勇王皓張磊劉磊李艷單位:吉林醫(yī)藥學(xué)院檢驗學(xué)院